与当前临床上普遍应用的其他影像技术，如CT、MRI、PET/CT等相比，PET/MR检查减少了如CT或PET/CT扫描时的辐射吸收剂量，具有更高的安全性，不仅发挥了MRI对于软组织分辨率高、扫描方式多、能够检测人体内化学环境与功能信号的能力，而且同时发挥了PET技术探测放射性核素在人体内分布情况，具有更精细准确发现病变位置和性质的能力。
并不是每一个人都适合进行PET/MR检测，因为PET/MR检查室是一个高磁场环境，任何铁磁性物品，包括非磁兼容的电器产品、金属物品会在高磁场环境下受到破坏，同时会干扰PET/MR图像质量，影响诊断结果，在极端条件下还可能对人体和设备造成危害。
因此体内装有心脏起搏器、除颤器、助听器、胰岛素泵、药物剂量控制装置等具有控制电路的植入式治疗装置的病人禁止进行PET/MR检查。
另外，无法配合检查的病人，如不能平卧，不能坚持完成检查，以及不能离开生命支持或其他辅助医疗装置的患者也不能行PET/MR检查。
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